De nombreux modes de coopération se sont développés au fil des ans et se poursuivent aujourd'hui. Ces partenariats se concrétisent sous diverses formes : co-élaboration d'études ou de méthodologies, collaboration sur des projets, notamment cofinancés, mobilisation d'experts issus d'autres établissements ou constitution d'équipes communes...
Principaux partenaires territoriaux

Association des maires de France et des présidents d'intercommunalité

Assemblée des communautés de France

Assemblée des départements de France

Association des régions de France

Villes de France

Association des Maires Ruraux de France

France Urbaine – métropoles, agglos et grandes villes

Association Nationale des Elus du Littoral

Association Nationale des Elus de Montagne

Caisse des Dépôts

Association des Ingénieurs Territoriaux de France

Association des Techniciens Territoriaux de France

Association des Directeurs Techniques des Métropoles, des Départements et des Régions

Agence France Locale
Principaux partenaires associatifs

Fédération nationale des agences d'urbanisme

Fédération nationale des associations d'usagers des transports

France nature environnement

Groupement des autorités responsables de transport

Fédération Nationale des Conseils d'Architecture, d'Urbanisme et de l'Environnement

Association de sociétés françaises d’autoroute

Fédération nationale des SCoT

Fédération des Parcs naturels régionaux de France

Fondation du patrimoine
Principaux partenaires scientifiques et techniques

Agence de la transition écologique

Office français de la biodiversité

Agence Française du Développement

Agence pour la qualité de la construction

Bureau de Recherches Géologiques et Minières

Centre National de la Fonction Publique Territoriale

Centre national de la recherche scientifique

Centre Scientifique et Technique du Bâtiment

Conservatoire du littoral

Institut des routes, des rues et des infrastructures pour la mobilité

Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux

Institut national de l’environnement industriel et des risques

Institut national de Recherche en Sciences et Technologies pour l’Environnement et l’Agriculture

Les agences de l'eau

Météo-France

Office National des Forêts

Service hydrographique et océanographique de la Marine

SNCF Réseau

Union des Syndicats de l'Industrie Routière Française

Voies navigables de France